סקר גנומי של הפטריות החיים על עורנו מהווה מסגרת להבנת האופן שבו חיידקים אלה תורמים לבריאות העור ולמחלותיהם.
קהילות מורכבות של חיידקים חיים על פני גופנו. פטריות, חיידקים ווירוסים אלה ידועים ביחד בשם מיקרוביום העור. צוות מהמכון הלאומי לחקר הגנום האנושי של NIH (NHGRI) והמכון הלאומי לסרטן (NCI) השתמש בעבר בטכניקות גנומיות לחקר חיידקי עור. הם מצאו קהילות חיידקים מגוונות שהיו שונות בין אנשים ולפי עור. במחקר החדש שלהם, הצוות השתמש בגישה גנומית דומה כדי להבין טוב יותר את הפטריות החיות על עורנו.
פטריות כוללות תבניות, פטריות ושמרים המשמשים לתסיסה של לחם ובירה. חיידקים אלה נקשרו למחלות ומצבי עור רבים, כולל כף רגל, אקזמה, קשקשים וזיהומים בציפורניים. על פי הערכות, כ -29 מיליון בני אדם ברחבי הארץ סובלים מזיהומים בעור פטרייתי. אבל פטריות יכולות להיות איטיות וקשות לגידול במעבדות, מה שמקשה על זיהוי וטיפול בזיהומים פטרייתיים.
ב- 22 במאי 2013 אספו המדענים דגימות ב -14 אתרי גוף מעשרה מבוגרים בריאים. הם התמקדו בשבר של DNA המשותף לכל הפטריות - המרווח הפנימי המתועתק הפנימי 10 (ITS1) של RNA ריבוזומלי - שיכול לשמש לסיווג פטריות ברמת הסוג עם דיוק גדול מ- 1%.
קבל את הדוא"ל האחרון
על ידי יצירת יותר מ -5 מיליון רצפי ITS1 מהדגימות, הצוות הצליח לזהות יותר מ -80 סוגים פטרייתיים ברמת סוג החיים על עור האדם. לעומת זאת, שיטות גידול מסורתיות יכלו לזהות רק 18 סוגים. נמצאו בכל אתרי העור. היו הסוג השולט ב -11 מתוך 14 האתרים, כולל מאחורי האוזניים, בנחיריים, על הגב ועל הזרועות.
הצוות גילה שעקבים, שאינם מראים גיוון חיידקי נרחב, הם האתר המורכב ביותר לפטריות, עם כ -80 סוגים המיוצגים. קורי הבוהן, עם כ -60 סוגים, וציפורני הרגליים, עם 40, היו בעלי הרמות הגבוהות הבאות של גיוון פטרייתי. בידיים ובזרועות, שיש בהן מגוון רב של חיידקים, היו סוגים מעטים יחסית של פטריות. קהילות הפטרייה בגוף הליבה היו יציבות למדי לאורך זמן, עם שינויים מועטים כאשר נבדקו בהפרש של עד 3 חודשים. לעומת זאת, פטריות בכפות הרגליים השתנו במידה ניכרת במשך 3 חודשים, ואולי משקפות יותר חשיפה סביבתית.
הקהילות הפטרייתיות בגוף האדם מורכבות וספציפיות לאתר ", אומרת הסופרת הבכירה ד"ר היידי קונג מ- NCI. על ידי השגת מודעות מלאה יותר למערכות האקולוגיות הפטריות והחיידקיות, נוכל לטפל טוב יותר במחלות עור הקשורות, כולל זיהומים פטרייתיים, שיכולים להיות קשורים לטיפולים בסרטן.
הנתונים מהמחקר שלנו נותנים לנו בסיס על אנשים רגילים שמעולם לא היו לנו ", אומרת הסופרת הבכירה ד"ר ג'ולי סגר מ- NHGRI. השורה התחתונה היא שכפות הרגליים שלך שופעות גיוון פטרייתי, אז ללבוש את הכפכפים בחדרי הלבשה אם אינך רוצה לערבב את פטריות כף הרגל שלך עם פטריות של מישהו אחר.